龙脉被封印，漩涡鸣人缓缓消失在了原地。
与他一起消失的，还有一个在远处的大和队长。
由于大蛇丸介入，导致大和队长没有与鸣人会合。
不过百足被打败，龙脉之力恢复，让他也一同回归到了原本时间线上。
而本土世界的波风水门则是一脸疑惑的望着龙脉封印，以及四周破损的建筑，带着队友们离开了此地。
时光荏苒，岁月流逝。
这个忍界的时间线再次恢复了正常状态，走起了原本的剧情。
波风水门回到木叶村没多久，忍界动荡，第三次大战全面爆发了起来。
首先是砂隐村的三代目风影失踪，砂隐村群龙无首，推崇军事扩张行动的雷之国率先行动，派遣云隐村趁火打劫，袭击风之国，并向土之国和火之国宣战。
一时间，岩隐村和木叶村被迫加入了战争。
在战争中，波风水门与云隐村的ab兄弟组合多次进行战斗，均是取得上风。
可就算赢了云隐村三代目雷影之子艾以及八尾人柱力奇拉比，波风水门依旧没有感到开心。
他内心隐隐，觉得自己的实力还是不够强大，仿佛有什么严重的事情要发生一般，可就是回想不起来。
战争结束后，波风水门成功继任了木叶村的四代火影，并与玖辛奈结婚。
同年，玖辛奈诞生下了鸣人，木叶爆发了九尾之乱，大批忍者死亡，战争阴云再起，云隐村与木叶村再次开战。
双方在边境线投入大量军事力量，最终以签订停战协议而告终。
之后又出现了大蛇丸叛逃，宇智波一族被灭门，鼬进入晓组织等事件。
时间一晃而过，来到了漩涡鸣人毕业，佐助叛逃离开木叶村，寻找大蛇丸寻求力量。
而为了追回佐助，鸣人在木叶村中努力修行，拜自来也为老师，学习螺旋丸。
之后自来也进入雨之国打探情报，死于六道佩恩之手，刺激了漩涡鸣人。
漩涡鸣人一边修炼，一边接取村子中的任务，努力锻炼自己。
而这一次，鸣人接到了前往风之国，追踪叛忍百足的任务。
在捉拿百足的途中，百足打开封印，二